Le configure ne dit pas grand chose, même quand il manque des ressources:
Pour la compilation, il me manquait bzlib.h:
libs/iostreams/src/bzip2.cpp:19:56: error: bzlib.h: No such file or directory
Ce header appartient en fait à libbz2-dev
Pour le support de GraphML, il faut libexpat, qui est une library de parsing XML.